fix: retire leftovers of the removed $DSH_HOME/config.yaml personal overlay

The profile rework left references to the old entry modes behind. Renames
the user patch-layer API and its spec file (watchPersonalPatches ->
watchUserPatches, personal-config.spec.ts -> user-patches.spec.ts) and
retargets the prose that still named `config.yaml`, `--config`, raw-config
mode, and surface overlays: repository-plugin and mcp-memory READMEs, the
credentials-local anchor into app-boot, vendor manifest items 12-13, the
vendored include/hmr comments, and install.sh.

Restores the boot-failure guard the rework dropped with raw mode: the
built-bin case now boots `--profile web --patch <invalid>` and asserts the
settled diagnostic and exit 1, so the HMR initial-scan deadlock stays
covered; its orphaned raw fixture is renamed and the unused one deleted.
The superseded personal-config Agent Note and its superseding profile note
are now cross-linked.

packages/credentials/credentials-local/README.zh.md

@@ -32,7 +32,7 @@ dotenv 格式，用 `dotenv` 解析；写回用物理行级编辑器，保留一
 
 ## 安全边界
 
-文档在 `0700` 目录下以 `0600` 权限存放，这挡得住其他 OS 用户，**挡不住**模型。工具进程（bash、文件系统工具）以同一用户身份运行，而已交付的 `workspace-write` 文件策略限制的是修改而非读取，因此它们读这个文件与读该用户拥有的任何其他文件毫无二致；也没有任何沙箱模式会把它单独挑出来。harness 真正守住的更窄：它绝不把该文档的解析后路径交给模型，也绝不把它载入进程环境（见 [app-boot 的个人配置](../../ui/app-boot/README.md#personal-config)），因此要拿到这个值，需要刻意去读一条并未交给 agent（智能体）的路径。
+文档在 `0700` 目录下以 `0600` 权限存放，这挡得住其他 OS 用户，**挡不住**模型。工具进程（bash、文件系统工具）以同一用户身份运行，而已交付的 `workspace-write` 文件策略限制的是修改而非读取，因此它们读这个文件与读该用户拥有的任何其他文件毫无二致；也没有任何沙箱模式会把它单独挑出来。harness 真正守住的更窄：它绝不把该文档的解析后路径交给模型，也绝不把它载入进程环境（见 [app-boot 的 Harness home 各层](../../ui/app-boot/README.md#profiles)），因此要拿到这个值，需要刻意去读一条并未交给 agent（智能体）的路径。
 
 这是审慎，不是边界。必须让提供方密钥远离自身 agent 的部署无法靠文件权限做到；OS 钥匙串提供方——一个模型的进程根本读不到的存储——才是延后的答案，它应当作为平级包与本提供方并列。